נושא קביעת משחקי הכדורגל בליגות השונות ובגילאים השונים, כמו גם במפעלים נוספים [גביע המדינה, גביע הטוטו וכו`] מופקד בידיה של ועדת הליגה והגביע, שהיא אחת הועדות החשובות ביותר הפועלות במסגרת ההתאחדות.
ועדה זו מונה כ- 3 חברים, מבין עובדי ההתאחדות. בראש הוועדה עומד מנכ"ל ההתאחדות.

בין סמכויות הועדה ותפקידיה:
1. אישור תוצאות משחקי הליגה והגביע ו/או ביטולן.
2. בדיקת מגרשים, אישורם או פסילתם למשחק והסדרת השימוש בהם.
3. טיפול במשאלות המוגשות ע"י הקבוצות בקשר למשחקי ליגה וגביע.
4. שיגור משקיפים למשחקי הליגה והגביע.
5. דחיית משחקי הליגה והגביע בליגות הנערים והילדים עקב מזג אוויר גרוע.

רובן של סמכויות אלה מפורטות בהרחבה בתקנון משחקי האליפות.
וועדה זו, בניגוד לרוב וועדות ההתאחדות, אינה וועדת משנה במעמד מייעץ בלבד.