חלק מרכזי ביותר בפעילות ההתאחדות בענף הכדורגל תופסת מחלקת הנוער והילדים.
מחלקה זו מכילה את המספר הרב ביותר של השחקנים הרשומים במועדונים השונים [סה"כ כ-30,000 שחקנים].
גוף העל המפקח על פעילות מחלקת הנוער והקובע את המדיניות המיוחדת למחלקה זו הוא ועדת הנוער.
מספר החברים בועדה אינו קבוע, אולם בד"כ נשמר בה, כבוועדות אחרות, האיזון המספרי בין מרכזי הספורט. חברי הוועדה אינם חייבים להיות אנשי ספורט במהותם ולעתים קרובות מתמנים לועדה חברים מקרב הציבור ואנשים חיצוניים, על חשבון נציגי המרכזים ובמקומם.
בראש ועדת הנוער עומד חבר הנהלת ההתאחדות ומנהל מחלקת הנוער בהתאחדות משמש חבר קבוע בה.
תפקידי הועדה:
1. ארגון תחרויות ליגה לקבוצות הנוער, הנערים והילדים של המועדונים החברים בהתאחדות.
2. ארגון משחקי הגביע או משחקים אחרים לנוער, נערים וילדים.
3. ארגון וייזום מפעלים בקבוצות הנוער, לרבות נבחרות אזוריות.
4. פיקוח על ניהול תקין של המפעלים השונים בליגות הנוער, נערים וילדים.
הועדה דנה בעניינים אלה, ומעבירה המלצותיה להנהלה או למזכירות ואלו מקבלות תוקף עם אישורן ע"י מוסדות אלה